La Reserva de Fauna Silvestre Ciénaga de La Palmita e Isla de Pájaros es un Área Bajo Régimen de Administración Especial (ABRAE) amenazada actualmente por diversos agentes tensores. Se determinaron perturbaciones en el cuerpo de agua, manglares y arbustales xerófilos espinosos deciduos. Las exploraciones, los recorridos y los trabajos de campo se realizaron entre septiembre 2019 y febrero 2020, y se detectaron alteraciones como disminución del suministro hídrico a la ciénaga (bajo nivel del agua) y valores altos de salinidad del agua superficial (45 y 75 ppm). Se evidenció la presencia de caza en el área, cambios en el suelo por asentamientos humanos, desarrollo de cultivos, pastoreo vacuno y caprino. Además, se destacó la tala, la quema de vegetación y la muerte de comunidades de mangles de Avicennia germinans, Conocarpus erectus y Laguncularia racemosa. Estos disturbios pueden generar consecuencias como cambios en la dinámica y la pérdida de la biodiversidad acuática de la ciénaga, salinización del cuerpo de agua, disminución de las densidades poblacionales ornitológicas, cambios en el uso del suelo, pérdida de la cubierta vegetal (suelos desnudos), incremento de la erosión eólica e hídrica hasta alcanzar niveles de desertización, fragmentación y pérdida de hábitats, de materia orgánica (hojarasca y detritus) y otros servicios ecosistémicos del manglar. El conocimiento científico obtenido sobre esta ABRAE sirve de información biológica de línea base para la formulación del Plan de Ordenamiento y Reglamento de Uso (PORU) de esta importante área natural protegida.
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